海峽兩岸農(nóng)業(yè)技術(shù)合作中心依托福建農(nóng)林大學，主要任務(wù)是加深兩岸農(nóng)業(yè)技術(shù)交流，充分發(fā)揮兩岸的技術(shù)優(yōu)勢，合作研發(fā)農(nóng)業(yè)高新技術(shù)，促進兩岸農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)融合，為解決兩岸農(nóng)業(yè)面臨的重大技術(shù)問題提供智力支持。中心的設(shè)立是農(nóng)業(yè)部繼建設(shè)海峽兩岸農(nóng)業(yè)合作試驗區(qū)、設(shè)立臺灣農(nóng)民創(chuàng)業(yè)園之后，推出的又一重要舉措。
據(jù)介紹，福建農(nóng)林大學率先開展臺灣現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技系統(tǒng)研究，目前擁有45個博士點專業(yè)，研究生3000余人，各類農(nóng)業(yè)科技教學科研人員2400余人。近年來先后與臺灣大學、中興大學、嘉義大學等91所高校和科研機構(gòu)進行了交流與合作，與32所臺灣農(nóng)業(yè)高等院校和科研機構(gòu)簽訂了合作協(xié)議；先后承擔了5項農(nóng)業(yè)部“948”項目，引進了臺灣各類優(yōu)質(zhì)農(nóng)產(chǎn)品良種和優(yōu)異種質(zhì)資源；該校在涉及兩岸農(nóng)業(yè)科技產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新方面的研究成果，先后獲得了國家技術(shù)發(fā)明獎二等獎、國家科技進步三等獎。
